Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms