Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFDQ9GZP0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms