Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms