Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN1Q9BY11 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms