Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms