Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIRIP3Q9BW71 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms