Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms