Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD2Q9BTF0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms