Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRACR2AQ9BSW2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRACR2AQ9BSW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRACR2AQ9BSW2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CRACR2AQ9BSW2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms