Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms