Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPF18Q99633 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms