Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms