Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms