Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG4Q92954 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms