Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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