Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRRC28Q86X40 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRC28Q86X40 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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