Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNMB4Q86W47 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms