Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-210ENST00000507452 680 ntTSL 311.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-206ENST00000458611 857 ntTSL 311.02□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 311.02□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 CASP9-205ENST00000424908 740 ntTSL 310.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RAP2C-203ENST00000460462 804 ntTSL 310.76□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF268-217ENST00000591951 612 ntTSL 310.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-215ENST00000531849 5084 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 510.55□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-217ENST00000509164 563 ntTSL 410.42□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-203ENST00000431839 1375 ntTSL 310.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 410.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R21-208ENST00000460299 448 ntTSL 210.32□□□□□ -0.768e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 REXO5-206ENST00000563617 813 ntTSL 510.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-228ENST00000514981 653 ntTSL 310.27□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 210.19□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 310.11□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-213ENST00000530562 2339 ntTSL 210.07□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R2-201ENST00000413183 706 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA8-207ENST00000498106 885 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-216ENST00000531852 690 ntTSL 310.01□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DNAH1-202ENST00000466628 223 ntTSL 59.96□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC37A3-222ENST00000490760 574 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-218ENST00000533990 645 ntTSL 39.76□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TEX2-203ENST00000581812 561 ntTSL 39.66□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 REXO5-213ENST00000567297 753 ntTSL 39.66□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-209ENST00000545236 868 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TMEM67-204ENST00000452276 1461 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AC004951.2-201ENST00000420754 789 ntBASIC9.54□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 29.43□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF395-206ENST00000520535 625 ntTSL 59.43□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DOCK4-210ENST00000468571 1259 ntTSL 39.43□□□□□ -0.98e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 29.4□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-214ENST00000569717 1947 ntTSL 29.34□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-207ENST00000565541 567 ntTSL 49.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 29.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R2-207ENST00000625807 245 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF782-207ENST00000498811 698 ntTSL 39.2□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PROM1-207ENST00000508167 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF18-204ENST00000595600 560 ntTSL 49.12□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TM7SF3-202ENST00000512808 623 ntTSL 58.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 GARNL3-219ENST00000495172 737 ntTSL 48.68□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF395-202ENST00000517372 573 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 THRB-211ENST00000447875 754 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC8.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ITGA10-201ENST00000369304 5269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RAC1-206ENST00000497741 651 ntTSL 28.53□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC37A3-215ENST00000477571 3488 ntTSL 58.47□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZSCAN29-206ENST00000566849 2834 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.068e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZSCAN29-201ENST00000396972 2831 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.068e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AAK1-204ENST00000461002 517 ntTSL 28.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.078e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 USP39-215ENST00000481409 447 ntTSL 38.23□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF268-204ENST00000534953 556 ntTSL 48.23□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-212ENST00000507546 496 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-221ENST00000510824 582 ntTSL 38.12□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ALKBH3-211ENST00000533200 517 ntTSL 58.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 REXO5-211ENST00000566518 993 ntTSL 58□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR91-204ENST00000466182 3594 ntTSL 27.98□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-224ENST00000512236 594 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BRAF-205ENST00000497784 2336 ntTSL 57.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BRCC3-207ENST00000411985 688 ntTSL 57.91□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 47.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-212ENST00000568815 573 ntTSL 47.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WIPI2-205ENST00000465102 643 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 LRRC14-207ENST00000530242 93 ntTSL 37.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF268-215ENST00000585488 575 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1802 ms