Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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MED27Q6P2C8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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