Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3F3CQ6NXT2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms