Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms