Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRT80Q6KB66 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms