Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RTL6Q6ICC9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms