Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms