Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIF1Q5UIP0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RIF1Q5UIP0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms