Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms