Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms