Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms