Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms