Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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