Protein–RNA interactions for Protein: Q16236

NFE2L2, Nuclear factor erythroid 2-related factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2Q16236 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2L2Q16236 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms