Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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