Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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