Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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