Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRT33BQ14525 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT33BQ14525 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms