Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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