Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNIQ14094 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNIQ14094 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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