Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKP1Q13835 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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