Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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