Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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