Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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