Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC1Q13547 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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