Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TUBB3Q13509 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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