Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCGQ13326 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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