Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXD4Q12950 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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