Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TRAF2Q12933 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF2Q12933 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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