Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMA1Q12791 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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