Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD47Q08722 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD47Q08722 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms