Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms