Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PUDPQ08623 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PUDPQ08623 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PUDPQ08623 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms